最新新闻News
我所桃资源与育种团队解析桃高质量基因组及果实香气遗传进化机制
时间:2021-08-02 08:07:38
点击:
桃汁多、味美,受到全世界广大消费者的喜爱。然而,随着长期以来育种家培育出大果、高糖和耐贮藏品种,消费者反映果实香气变淡、桃没桃味。利用基因组是研究果实重要农艺性状的有力工具。7月26日,Plant Journal在线发表了中国农科院郑州果树所王力荣和曹珂研究员为通讯作者的题为“New high-quality peach (Prunus persica L. Batsch) genome assembly to analyze the molecular evolutionary mechanism of volatile compounds in peach fruits”的研究论文。该研究首先利用二代、三代和Hi-C测序技术完成了一份我国重要的地方品种‘早上海水蜜’的基因组组装,其Scaffold N50达到29.68 Mb,略高于参考基因组‘Lovell’的27.37 Mb,但其基因组gap数量(165)明显小于‘Lovell’的2090个。将‘早上海水蜜’基因组与参考基因组比较,共鉴定出685407个SNPs、162655个Indels以及16248个SVs(图1)。基因家族的扩张和收缩分析表明,编码黄酮、黄酮醇、类黄酮和单萜的基因家族明显收缩。
关键词: